Layanan Berita Ekspres
BHUBANESWAR: Sebagai langkah besar menuju pemberantasan TBC, para ilmuwan di Institute of Life Sciences (ILS), Bhubaneswar telah melakukan pengurutan genom TBC yang akan membantu memprediksi TBC yang resistan terhadap obat dan meningkatkan pendekatan diagnostik dan terapeutik.
Studi tentang keragaman genetik, evolusi, pola penularan dan perkembangan resistensi obat, yang dilakukan untuk pertama kalinya di negara bagian Odisha dan Timur Laut bekerja sama dengan Regional Medical Research Center (RMRC), Bhubaneswar, Bhubaneswar, memberikan wawasan tingkat molekuler tentang Mycobacterium tuberkulosis (MTB ) suku. wilayah timur dibandingkan dengan perspektif India dan global.
Ketika pandemi Covid-19 mengganggu kemajuan yang dicapai dalam beberapa tahun terakhir dalam diagnosis TBC dan berkurangnya akses terhadap pengobatan TBC, dampak yang paling nyata terlihat: penurunan jumlah kasus TBC yang baru didiagnosis dan dilaporkan. Penurunan tajam sebesar 18 persen (pc) terlihat dari data yang dikumpulkan hingga Juni 2021.
Meskipun kasus yang rentan terhadap obat memiliki tingkat keberhasilan pengobatan yang lebih tinggi, kasus resistensi multi-obat (MDR) dan kasus TB yang resistan terhadap obat secara ekstensif (TB XDR) memiliki tingkat keberhasilan pengobatan hanya 54 persen. dan 30 persen, masing-masing.
Tantangan utama dalam strategi diagnostik TB saat ini adalah waktu yang diperlukan untuk tes berbasis kultur (tiga hingga enam minggu) dan diagnostik molekuler yang tersedia secara komersial gagal memperhitungkan mutasi kompensasi baru yang mengarah pada perkembangan resistensi obat.
Dalam studi baru-baru ini, para ilmuwan mengurutkan 118 keseluruhan genom MTB yang positif kultur, termasuk tujuh sampel tindak lanjut, yang dikumpulkan dari 111 pasien di Odisha, Sikkim dan Meghalaya. Meskipun sampel dari Odisha sebagian besar terdiri dari sampel yang rentan terhadap obat, sampel dari wilayah timur laut merupakan campuran sampel MDR dan XDR karena resistensi fluoroquinolone sangat umum di wilayah tersebut.
Para peneliti secara ekstensif mempelajari keragaman genom strain Lineage 2 yang resisten terhadap Fluoroquinolone bersama dengan strain Lineage 1 dan Lineage 3. Mereka mendeteksi total 12.926 varian nukleotida tunggal berkualitas tinggi dan mengamati perbedaan drastis antara distribusi gender MTB di wilayah timur laut dan Odisha.
Silsilah-1 yang juga dikenal dengan silsilah Indo Samudera lebih menonjol di Odisha dan Silsilah-2 yang juga dikenal dengan silsilah Beijing mempunyai kehadiran yang sangat dominan di wilayah timur laut. Representasi strain MTB yang sangat beragam telah diamati dan ketiga garis keturunan yang ditemukan di negara tersebut ditemukan di Negara Bagian tersebut. Jalur 1 dominan disusul jalur 3 dan 2.
Ilmuwan senior ILS Dr Sunil Raghav mengatakan penelitian yang menyelidiki pola penularan strain MDR dan pola perolehan mutasinya, selain dari kinerja prediksi fenotip resistensi obat, memberikan peluang besar untuk mengembangkan pendekatan diagnostik dan terapeutik serta meningkatkannya.
“Negara bagian ini juga melihat adanya generasi ketiga, yang juga dikenal sebagai keturunan Asia Tengah.
Kami memeriksa distribusi garis keturunan di berbagai distrik untuk lebih memahami wilayah yang paling terkena dampak dan menemukan bahwa distrik selatan Odisha sebagian besar terkena dampak garis keturunan-1, sementara distrik tengah dan timur memiliki kehadiran campuran dari ketiga generasi tersebut,” katanya.
Dari 48 sampel yang diurutkan dari Odisha, 39 sampel rentan terhadap obat dan dua sampel diklasifikasikan sebagai resisten tunggal dan tujuh sisanya sebagai MDR. Median usia pasien yang terdaftar dalam penelitian ini adalah 32 tahun yang terdiri dari 57 laki-laki dan 44 perempuan.
Meskipun Odisha memiliki lebih sedikit beban terhadap TB yang resistan terhadap obat, jumlah kasus yang dilaporkan juga lebih sedikit karena kurangnya fasilitas kesehatan terdekat dan pilihan gaya hidup yang buruk, demikian temuan studi tersebut.
Dr Raghav mengatakan studi genom skala besar diperlukan untuk memahami dinamika populasi MTB yang sangat beragam di India untuk merancang metode diagnostik spesifik wilayah yang lebih baik.
“Pengurutan skala besar juga akan membantu meningkatkan tes diagnostik molekuler berbiaya rendah yang sudah tersedia. Panel yang ditargetkan dapat dikembangkan dengan menggunakan studi untuk memprediksi fenotip resistensi obat langsung dari sampel dahak dalam jangka waktu singkat menggunakan pendekatan pengurutan paralel masif. . ” dia menambahkan.
Menurut Laporan Tuberkulosis Global WHO terbaru, 26 pc. Kasus TBC baru berasal dari India yang merupakan negara dengan beban TBC tertinggi di antara negara-negara dengan beban TBC tinggi, disusul oleh Tiongkok dengan sembilan persen. kasus baru Anda yang dilaporkan. India mempunyai prevalensi kasus MDR tertinggi kedua dengan angka kematian tertinggi.
Ikuti saluran The New Indian Express di WhatsApp