India tertinggal dalam pengurutan genom sampel virus, kata penelitian – The New Indian Express

Layanan Berita Ekspres

HYDERABAD: India merupakan negara dengan jumlah kasus Covid-19 tertinggi kedua di dunia, namun ketika menyangkut pengurutan genom virus corona baru, kinerja negara tersebut sangat mengejutkan.

Dari lebih dari 1,01 crore kasus yang dilaporkan di India, sejauh ini hanya 4.238 sampel virus corona baru atau hanya sekitar 0,04 persen dari seluruh kasus yang telah diurutkan, menurut database genom virus corona baru yang diurutkan secara global dengan inisiatif GISAID.

Bahkan jumlah ini tidak tersebar secara merata di seluruh geografi negara. Meskipun Andhra Pradesh dan Tamil Nadu mencatat jumlah kasus Covid-19 tertinggi ketiga dan keempat, hanya 3 dan 36 sampel virus yang berhasil dilacak dari negara-negara bagian tersebut.

Mengapa itu buruk? Dr Rakesh Mishra, direktur Pusat Biologi Seluler dan Molekuler yang berbasis di Hyderabad, mengatakan kepada Express: “Inggris dapat mengidentifikasi bentuk mutasi virus corona baru yang lebih menular karena mereka telah mengurutkan sejumlah besar sampel virus. Inggris juga dalam kondisi siaga tinggi. sebagai akibat.”

Menurut database Inisiatif GISAID, Inggris memiliki 1.35.572 sampel virus berturut-turut, yang merupakan 6,1 persen dari total kasus yang tercatat di Inggris (22,2 lakh pada hari Sabtu).

Apa yang menghentikan laboratorium di India untuk melacak lebih banyak sampel virus? Mishra mengatakan bahwa kendala terbesarnya adalah biaya, bukan pada mesin yang digunakan untuk sequencing yang tersedia di banyak institusi, namun bahan habis pakai yang digunakan untuk Next Generation Sequencing, yang diimpor.

Selain tingginya biaya bahan habis pakai NGS, kendala lainnya adalah kurangnya akses terhadap sampel virus bagi institusi yang dapat melakukan pengurutan genom, kata mantan direktur CCMB Dr Ch Mohan Rao.

Dr Rao berkata: “Ada banyak institusi pemerintah dan swasta di negara ini, termasuk di Hyderabad, yang memiliki mesin yang diperlukan untuk pengurutan genom virus. Namun, banyak dari institusi tersebut tidak memiliki akses terhadap sampel untuk pengurutan. jangan’ tidak ambil.”

Namun, Dr Rao menekankan bahwa karena tingginya biaya pengurutan, India tidak perlu mengurutkan sampel virus dalam jumlah yang sangat besar karena virus diketahui sering bermutasi dan tidak setiap mutasi berbahaya atau lebih menular.

Apa yang bisa dilakukan? Mishra menekankan bahwa strategi harus diterapkan dalam penggunaan pengurutan untuk memastikan bahwa meskipun jumlahnya tidak terlalu besar dan mengakibatkan beban keuangan, pengurutan yang cukup digunakan untuk melacak mutasi. Hal ini harus dilakukan untuk mendeteksi secara dini bentuk virus yang bermutasi lebih buruk dan mengambil tindakan pencegahan.

Indikator utama kinerja pengurutan genom India.

Sesuai dengan database Inisiatif GISAID.

Sampel virus corona baru yang diurutkan secara global – 2.92.709.

India – 4.238.

• Maharashtra – 1.336.

• Telangana – 672.

• Gujarat – 622.

• Delhi – 418.

• Karnataka – 258.

Ikuti saluran The New Indian Express di WhatsApp

</p> <p>HYDERABAD: India merupakan negara dengan jumlah kasus Covid-19 tertinggi kedua di dunia, namun ketika menyangkut pengurutan genom virus corona baru, kinerja negara tersebut sangat mengejutkan. Dari lebih dari 1,01 crore kasus yang dilaporkan di India, sejauh ini hanya 4.238 sampel virus corona baru atau hanya sekitar 0,04 persen dari seluruh kasus yang telah diurutkan, menurut database genom virus corona baru yang diurutkan secara global dengan inisiatif GISAID. Bahkan jumlah ini tidak tersebar secara merata di seluruh geografi negara. Meskipun Andhra Pradesh dan Tamil Nadu mencatat jumlah kasus Covid-19 tertinggi ketiga dan keempat, hanya 3 dan 36 sampel virus dari negara-negara bagian tersebut yang diurutkan.googletag.cmd.push(function() googletag.display(‘div-gpt -ad-8052921-2’); ); Mengapa itu buruk? Dr Rakesh Mishra, direktur Pusat Biologi Seluler dan Molekuler yang berbasis di Hyderabad, mengatakan kepada Express: “Inggris dapat mengidentifikasi bentuk mutasi virus corona baru yang lebih menular karena mereka telah mengurutkan sejumlah besar sampel virus. Inggris juga dalam kondisi siaga tinggi. sebagai akibat.” Menurut database Inisiatif GISAID, Inggris memiliki 1.35.572 sampel virus berturut-turut, yang merupakan 6,1 persen dari total kasus yang tercatat di Inggris (22,2 lakh pada hari Sabtu). Apa yang menghentikan laboratorium di India untuk mengurutkan lebih banyak sampel virus? Mishra mengatakan bahwa kendala terbesarnya adalah biaya, bukan pada mesin yang digunakan untuk pengurutan yang tersedia di banyak institusi, namun bahan habis pakai yang digunakan untuk pengurutan Generasi Berikutnya, yang diimpor. Selain tingginya biaya bahan habis pakai NGS, kendala lainnya adalah kurangnya akses terhadap sampel virus bagi institusi yang dapat melakukan pengurutan genom, kata mantan direktur CCMB Dr Ch Mohan Rao. Dr Rao berkata: “Ada banyak institusi pemerintah dan swasta di negara ini, termasuk di Hyderabad, yang memiliki mesin yang diperlukan untuk pengurutan genom virus. Namun, banyak dari institusi tersebut tidak memiliki akses terhadap sampel untuk pengurutan. Namun, Dr Rao menunjukkan bahwa karena tingginya biaya pengurutan, India tidak perlu mengurutkan sampel virus dalam jumlah yang sangat besar, karena virus diketahui sering bermutasi dan tidak setiap mutasi berbahaya atau tidak lebih menular. Apa yang bisa dilakukan? Mishra menekankan bahwa strategi harus diterapkan dalam penggunaan pengurutan untuk memastikan bahwa meskipun jumlahnya tidak terlalu besar dan mengakibatkan beban keuangan, pengurutan yang cukup digunakan untuk melacak mutasi. Hal ini harus dilakukan untuk mendeteksi secara dini bentuk virus yang bermutasi lebih buruk dan mengambil tindakan pencegahan. Indikator utama kinerja pengurutan genom India. Sesuai dengan database Inisiatif GISAID. Sampel virus corona baru yang diurutkan secara global – 2.92.709. India – 4.238. Maharashtra – 1.336. Telangana – 672. Gujarat – 622. Delhi – 418. Karnataka – 258. Ikuti Saluran Indian Express Baru di WhatsApp<br />