NEW DELHI: Para peneliti di Institut Teknologi India, Mandi (IIT Mandi) di Himachal Pradesh telah mengungkap bagian dari struktur protein utama dalam virus COVID-19, membantu memahami cara kerjanya, perannya dalam penyebaran dan tingkat keparahannya. penyakit dan pengembangan terapi antivirus.
Temuan ini dipublikasikan dalam jurnal ‘Current Research in Virological Science’.
Menurut tim, pengobatan COVID-19 saat ini hanya mengatasi gejala sementara tubuh melawan infeksi dengan sistem pertahanan kekebalannya.
Belum ada obat antivirus yang dapat menghentikan replikasi virus.
“Salah satu cara untuk menetralisir virus apa pun adalah dengan menyerang proteinnya. Pendekatan semacam itu juga berlaku pada virus COVID-19, dan para ilmuwan di seluruh dunia sedang melakukan penelitian untuk menjelaskan struktur dan fungsi protein-protein ini guna memahami penyakit virus dan mengembangkan penyakit. obat yang efektif melawan virus,” kata Rajanish Giri, Asisten Profesor Bioteknologi, IIT Mandi.
Virus ini memiliki 16 protein non-struktural (NSP1-NSP16), dimana NSP1 berperan penting dalam patogenisitas (kemampuan menyebabkan penyakit) virus.
“NSP1 mengganggu protein sel inang dan menekan fungsi kekebalannya. Pentingnya hal ini dapat dipahami dari fakta bahwa NSP1 juga disebut ‘faktor penghentian inang’. Sebelumnya pada tahun 2020, kami menunjukkan melalui studi bioinformatika bahwa NSP1 C-terminal wilayah ini memiliki kecenderungan gangguan intrinsik antara skala 0,4 hingga 0,5—sangat dekat dengan batas prediksi gangguan intrinsik.”
“Namun, tanpa studi eksperimental, kami tidak yakin bahwa wilayah asam amino 131-180 ini sebenarnya merupakan wilayah protein yang tidak teratur secara intrinsik. Secara umum, wilayah ini terbentang dalam larutan, namun terlipat menjadi konformasi spesifik ketika berinteraksi dengan molekul atau pasangan tertentu. di dalam inangnya mengikat sel,” kata Giri menjelaskan perkembangan terkini dari penelitian sebelumnya.
Tim IIT Mandi secara eksperimental mempelajari konformasi struktural SARS-CoV-2 NSP1 dalam berbagai kondisi – dalam pelarut organik, lingkungan mimesis membran, dan di dalam liposom.
Dengan menggunakan teknik analisis seperti spektroskopi dikroisme sirkular, spektroskopi fluoresensi, dan simulasi dinamika molekul, para peneliti menunjukkan perubahan dinamis dalam konformasi IDR NSP1, sebagai respons terhadap lingkungannya, akibat interaksi hidrofobik dan elektrostatik antara protein dan lingkungan. .
“Temuan kami memberikan wawasan berharga mengenai ketidakteraturan konformasi wilayah terminal C NSP1 (residu 131-180) dari virus SARS-COV2 di berbagai lingkungan, yang akan membantu untuk memahami aspek NSP1 yang lebih luas dan interaksinya dengan mitra pengikat untuk memahaminya. yang saat ini belum diketahui,” kata Giri.
Anggota tim lainnya termasuk peneliti IIT Mandi Amit Kumar, Ankur Kumar dan Prateek Kumar, serta Neha Garg dari Universitas Hindu Banaras.
Ikuti saluran The New Indian Express di WhatsApp